Цитата: Мне немного непонятно: при формировании корректировочного счета фактуры не будет скорректирован прошлый период?
Нет. По корректировочному счету-фактуре корректировка (доначисление НДС или вычет ранее излишне начисленного НДС) производится в квартале, когда собраны все документы, на основании которых выписан корректировочный счет-фактура.
Цитата: у меня она в программе не проводится, потому, что закрыт год.
Наверное, потому, что Вы пытаетесь сделать корректировочный счет-фактуру датой 2016 года. А нужно текущей датой (2017 года).
Цитата: у покупателя вообще эта сумма не прошла! У него приход меньше, чем у нас продажа ему.
Всё правильно, он принял товар по факту, а не по ошибочно выписанным документам. Непонятно только, почему Вам не сообщил...
Успехов!